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中国科学技术大学研究生院成立于1978年，是经国务院批准创办的中国首个研究生院。建院之初在北京，1986年时更名为中国科学技术大学研究生院（北京），同时中国科学技术大学在合肥校本部建立中国科学技术大学研究生院（合肥）。中国科学技术大学研究生院（北京）在2000年改名为中国科学院研究生院，划归中国科学院直属。2012年6月中国科学院研究生院更名为中国科学院大学，2014年中国科学院大学开始招收本科生。
1981年，学校被国务院批准为首批博士、硕士学位授予单位。1983年，在人民大会堂举行的我国首批18名博士学位授予仪式中，有6名来自中国科大。 [1]1978年恢复研究生招生至2024年7月，学校累计已授予博士学位21159名，学术硕士学位24506名，专业硕士学位34247名。截止到2024年7月，在学博士研究生9146人，全日制学术硕士研究生6747人，全日制专业学位硕士6673人，非全日制专业硕士学位1702人，中国科学院研究所代培研究生865人。
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